Perspectiva general sobre el proceso de desarrollo de fármacos…
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Tabla 1.-‐
Relación entre la dimensionalidad de los descriptores y la complejidad de la
representación que describen.
Dimensión Representación Típica Descriptores Típicos
0D
C9H8O4
Descriptores constitucionales
(e.g., Peso molecular, Conteo de átomos)
1D
Conteo de grupos funcionales
2D
Descriptores topológicos
3D
Descriptores geométricos
4D
Energía de interacción
Otra clasificación de los DMs que aunque no se menciona explícitamente en
los textos quimioinformáticos tiene una importancia trascendental a la hora de
aplicar la modelización estadística y/o de aprendizaje automático es la de acorde a
la naturaleza numérica de definición de los mismos, esto es, en continuos y
discretos. Por ejemplo, la mayoría de los descriptores implementados en el
software DRAGON son continuos, las principales excepciones son los bloques
constitucionales
, donde se pueden encontrar varios descriptores con valores
discretos, y todos resultan ser los “contadores” (number of atoms, etc); los bloques
de
grupos funcionales
y
fragmentos centrados en átomos
, todos son contadores y
por ende tienen valores discretos; algunos descriptores de
propiedades
moleculares
, los descriptores tipo-‐fármacos que comienzan en LAI y terminan en
Infective-‐50 son binarios o
booleanos
(1/0); las
huellas dactilares binarias 2D
todas
son binarias (1/0); las
huellas dactilares de frecuencia 2D
, todos tienen valores
discretos.
