Óscar Miguel Rivera Borroto & col.
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Más recientemente, con el aumento significativo de la potencia de los
ordenadores, incluso en PCs de escritorio, los métodos para identificar
directamente los rasgos de las moléculas 3D se han vuelto más frecuentes. Las
características aquí se refieren generalmente a diversos tipos de campos
moleculares, algunos, como la densidad electrónica ("estérica"), otros como los
campos potenciales eléctricos (26) y también como campos potenciales lipofílicos
(68). Los campos moleculares son generalmente representados como funciones
continuas. Los campos discretos también se han utilizado aunque algo menos
frecuente (69).
De acuerdo a la naturaleza en su definición y a la complejidad de los rasgos
moleculares estructurales que se codifican, los DMs se clasifican de forma general
según las dimensiones que abarcan en: DMs-‐0D (Descriptores Constitucionales),
DMs-‐1D (Descriptores Unidimensionales), DMs-‐2D (Descriptores Bidimensionales
o Invariantes de Grafos), DMs-‐3D (Descriptores Tridimensionales), y DMs-‐4D
(Descriptores Tetradimensionales).
Los DMs-‐0D son descriptores que se obtienen directamente de la fórmula
molecular y son independientes de cualquier conocimiento sobre la estructura
molecular, por ejemplo, el número de átomos (A), el peso molecular (MW), conteo
de átomos-‐tipo (Nx) o cualquier función de las propiedades atómicas. Los DMs-‐1D
están basados en la representación unidimensional de la molécula (o
representación que consiste en una lista de fragmentos estructurales de la
molécula), aunque no requieren del conocimiento completo de la estructura
molecular, tal es el caso de los descriptores de búsqueda y análisis subestructural,
como los Descriptores de Conteo de Fragmentos.
Los DMs-‐2D se basan en la representación bidimensional o
topológica
de la
molécula, o sea, que consideran la conectividad de los átomos (vértices) en la
molécula (pseudografo) en términos de la presencia y naturaleza de los enlaces
químicos (aristas). Los DMs-‐3D son derivados de la representación tridimensional
de la molécula y se basan no solo en la naturaleza y conectividad de los átomos,
sino también en la configuración espacial de la molécula.
Finalmente los DMs-‐4D son descriptores basados no solo en la
configuración espacial de la molécula, sino también en los campos escalares de
interacción que se originan como consecuencia de la distribución electrónica en
dicha entidad química, tales como los Valores de la Energía de Interacción (39).