Perspectiva general sobre el proceso de desarrollo de fármacos…
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Donde, α = 20 la métrica del clasificador aleatorio toma el valor
AUC[CROC]
aleat
= 0.2809
4. CONCLUSIONES
El proceso tradicional de descubrimiento y desarrollo de nuevos fármacos
es muy costoso en términos de recursos materiales y de tiempo. Una alternativa
viable y complementaria a este paradigma es el método de cribado virtual
in silico
,
cuya esencia radica en manipular de forma racional en términos explicativos, de
diseño y predictivos el gran volumen de información procedente del cribado de
alto rendimiento y quimiotecas virtuales. Una de las técnicas que resaltan por su
alta eficiencia y comprobada efectividad es la búsqueda de similitud, que contando
solamente con un ordenador potente, un conjunto de datos químicos
in silico
, una
medida de similitud, un algoritmo de emparejamiento e información acerca de una
única molécula bioactiva de consulta, o al menos unos pocos rasgos estructurales
de interés, es capaz de recuperar las moléculas más parecidas a la referencia, que a
su vez tienen la mayor probabilidad de exhibir la bioactividad estudiada. El
panorama actual brinda una magnífica oportunidad para el uso y explotación de
estas técnicas en la solución de problemas de la química medicinal ya que, al igual
que en el caso de la bioinformática, los recursos quimioinformáticos siguen
pasando aceleradamente al dominio público. A pesar de ello, se debe seguir
velando por la rigurosidad y calidad de los modelos y soluciones puesto que los
productos finales serán usados en humanos, demás animales, plantas y el medio
ambiente en general. Para validar y usar nuevas técnicas (nuevos descriptores,
medidas de similitud, algoritmos de búsqueda) recomendamos usar conjuntos de
datos no sesgados, curados y representativos del contexto bioactivo a investigar;
usar representaciones moleculares eficientes pero informativas; usar técnicas de
selección de rasgos (automática) cada vez que sea posible y usar estos rasgos
seleccionados en las búsquedas “no supervisadas” de otros repositorios grandes;
emplear validación cruzada, cuando sea apropiado, para obtener un estimado
promedio del desempeño en las distintas regiones del espacio de entrenamiento, y
finalmente, comprobar la calidad de las predicciones a través de evaluaciones
experimentales de la actividad
in vitro
e
in vivo
. Esperamos que en los años
venideros, con la disponibilidad de mayores recursos virtuales gratuitos, un mayor
grado en la comprensión del enigma encantador de la similitud molecular y los
mapas de similitud, y contando con algoritmos de búsqueda eficientes y
ordenadores veloces, seremos capaces de adentrarnos cada vez más en el “espacio
astronómico químico” descubriendo otras “galaxias de compuestos líderes” y
aportando soluciones eficaces en términos de entidades farmacológicas noveles en
favor de una mayor calidad de vida y longevidad del ser humano.
