BORIS GUZMÁN FERNÁNDEZ & col
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fallos en la selección de compuestos candidatos a fármacos en los ensayos clínicos,
mediante el filtrado de bibliotecas combinatorias.
El cribado virtual o
virtual screening
permite identificar a los compuestos
que presentan toxicidad y/o malas características farmacocinéticas (5), al
principio de la fase de desarrollo del fármaco.
Por último, aplicando esta metodología se logra cribar los muchos
compuestos que suelen mostrar actividad inespecífica en varios ensayos y que rara
vez resultan ser verdaderamente eficaces o activos (6).
En la búsqueda de relaciones cuantitativas estructura-‐actividad, la
topología molecular (TM), se ha convertido en la actualidad en una herramienta
muy útil para caracterizar estructuralmente a una molécula y por tanto predecir de
forma rápida y precisa diversas propiedades fisicoquímicas y biológicas de la
misma (7-‐14).
Con ayuda de TM las moléculas son caracterizadas estructuralmente a
través de los índices topológicos (IT) (15). Estos IT son capaces de caracterizar las
propiedades fisicoquímicas y biológicas de una determinada molécula (tamaño
molecular, presencia de ciclos, ramificaciones…etc.). El cálculo de IT no es
complejo, y tiene muchas ventajas. Una de las principales ventajas, reside en el
hecho de que los descriptores topológicos no están atados a su disposición dentro
de la molécula. Es decir, son valores invariables de la molécula y no depende de la
conformación de la misma en un determinado momento.
Por medio de diversos enfoques estadísticos llegamos a la obtención de un
modelo topológico, es decir una ecuación matemática basada en estos IT para una
determinada propiedad físico-‐química o biológica. Después de la obtención del
modelo topológico para la predicción de una determinada actividad farmacológica,
un cribado virtual, se lleva a cabo con el fin de rastrear e identificar nuevos
compuestos con la actividad farmacológica deseada (15, 16).
Los índices topológicos se han utilizado para la predicción de diversas
propiedades fisicoquímicas y biológicas en grupos de compuestos con una amplia
diversidad estructural (15,17).
El método topológico ha sido aplicado por la “Unidad de Diseño de
Fármacos y Conectividad Molecular” de la Universitat de Valencia, para la
búsqueda de nuevos compuestos anti-‐protozoarios (18), anti-‐maláricos (19, 20),
los anti-‐microbianos (21, 22), anti-‐fúngicos (23), anti-‐neoplásicos (24), agentes
broncodilatadores (25, 26), citostáticos (27), anti-‐inflamatorios (7,16,28), anti-‐
virales VIH-‐1 (29), compuestos activos frente a Colitis ulcerosa (30) y compuestos
antihistamínicos (31).
